Aciclovir wird lokal und systemisch zur Behandlung oder Vorbeugung von Infektionen mit dem Herpes-simplex-Virus (HSV) Typ 1 und 2 sowie mit dem Varizella-Zoster-Virus (VZV) angewendet. Die Haupteinsatzgebiete sind Lippenherpes (Herpes labialis), Genitalherpes (Herpes genitalis), Gürtelrose (Herpes zoster) und Windpocken. Zudem wird das Virostatikum bei Herpes-simplex-Enzephalitis, Zoster ophthalmicus und Herpes neonatorum (eine akute Primärinfektion des Neugeborenen mit HSV) angewendet.
